科研团队
大健康研究院 研究员
个人简介:
柯纪元,男,2004年毕业于美国普渡大学获得博士学位;2004-2007年在美国肯塔基医学院从事博士后研究工作;2007-2016年在美国范安德研究所(Van Andel Institute)结构生物学实验室工作;2016年至今先后在NewLink Genetics, H3 Biomedcine和Tarapeutics工作。长期致力于癌症相关信号通路,蛋白质大分子或大分子复合物的结构和功能关系的研究(Src激酶,叶酸受体,Frizzled受体,FGFR受体,Dnmt3A,PPARg,STAT5)。近六年来一直从事抗癌靶向药的研发工作。以第一作者或共同第一作者的身份在国际知名期刊Nature(2013、2015)、Nat Struct Mol Biol(2013)、Genes Dev(2013、2017)、Cell Research(2015)等杂志上发表研究论文。共发表学术论文33篇,总引用次数超过3000次,H-index为23。
研究兴趣及方向:
课题组将以临床价值为导向,深入研究一些重要的癌症靶点的结构和功能关系,在临床上对不同适应症的应用。根据研究的发现,针对重要的靶点进行抗肿瘤药物的研发工作。现阶段将研究肿瘤代谢,肿瘤表观遗传学,以及Wnt信号通路在肿瘤和肿瘤免疫中的作用。
代表性工作:
1. Brawn RA, Cook A, Omoto K, Ke J, Karr C, Colombo F, Virrankoski M, Prajapati S, Reynolds D, Bolduc DM, Nguyen TV, Gee P, Borrelli D, Caleb B, Yao S, Irwin S, Larsen NA, Selvaraj A, Zhao X, Ioannidis S. Discovery of Aminopyrazole Derivatives as Potent Inhibitors of Wild-Type and Gatekeeper Mutant FGFR2 and 3. ACS Med Chem Lett. 2020 Dec 2;121:93-98.
2. Yao S, Nguyen TV, Rolfe A, Agrawal AA, Ke J, Peng S, Colombo F, Yu S, Bouchard P, Wu J, Huang KC, Bao X, Omoto K, Selvaraj A, Yu L, Ioannidis S, Vaillancourt FH, Zhu P, Larsen NA, Bolduc DM. Small Molecule Inhibition of CPS1 Activity through an Allosteric Pocket. Cell Chem Biol. 2020 Mar 19;273:259-268.e5.
3. DeBruine ZJ*, Ke J*, Harikumar KG*, Gu X, Borowsky P, Williams BO, Xu W, Miller LJ, Xu HE, Melcher K. Wnt5a promotes Frizzled-4 signalosome assembly by stabilizing cysteine-rich domain dimerization. Genes Dev. 2017 May 1;319:916-926. *equal contribution
4. Shen G*, Ke J*, Wang Z, Cheng Z, Gu X, Wei Y, Melcher K, Xu HE, Xu W. Structural basis of the Norrin-Frizzled 4 interaction. Cell Res. 2015 Sep;259:1078-81. *equal contribution
5. Ke J, Harikumar KG, Erice C, Chen C, Gu X, Wang L, Parker N, Cheng Z, Xu W, Williams BO, Melcher K,Miller LJ, Xu HE. Structure and assembly of Norrin–activated Frizzled 4 and Lrp5/6 complex. Genes Dev. 2013 Nov 1;2721:2305-19. The cover article. Highlighted in Nature Chemical Biology 10, 22014 doi:10.1038/nchembio.1418 SIGNALING: A Norrin trio
6. Chen C*, Ke J*, Zhou XE, Yi W, Brunzelle JS, Li J, Yong EL, Xu HE, Melcher K. Structural basis for molecular recognition of folic acid by folate receptors. Nature 2013 Aug 22; 5007463: 486-9. *equal contribution
7. Ke J*, Chen RZ*, Ban T*, Zhou XE, Gu X, Tan MH, Chen C, Kang Y, Brunzelle JS, Zhu JK, Melcher K, Xu HE. Structural basis for RNA recognition by a dimeric PPR protein complex. Nat Struct Mol Biol. 2013 Dec; 2012:1377-82. *equal contribution
8. Ke J, Chelvarajan RL, Sindhava V, Robertson DA, Lekakis L, Jennings CD, Bondada S. The Anomalous constitutive Src kinase activity promotes B lymphoma survival and growth. Mol. Cancer 2009; 8:132.