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AI与小分子药物中心

黄云

副研究员


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个人简介:

2018年毕业于中国科学技术大学物理化学系,获理学博士学位。研究生期间主要研究方向是蛋白分子动力学模拟理论计算。2019年至2024年就职于国内材料与生命科学相关的软件开发公司从事分子模拟与人工智能平台搭建和开发工作,其间获评苏州工业园区高层次人才,姑苏重点产业紧缺人才的称号。20252月加入大健康研究院先进医药与再生医学研究所宋明虎课题组,担任副研究员,从事计算化学和人工智能应用在药物设计中的研究工作。


研究兴趣及方向:

课题组理论计算主要有两个方向:一个是分子模拟在药物研发中的应用,通过分子模拟预测靶蛋白结构和药物分子活性;另一个是基于片段的人工智能药物设计,包括小分子药物片段蛋白相互作用知识图谱库、基于片段的药物分子生成等。

代表性工作:

1.Huang, Y., Zhu, C., Liao, J., Gu, X. K., & Li, W. X. 2023. First-principles study of the effect of the local coordination environment on the electrochemical activity of Pd1-CxNy single atom catalysts. Chemical Engineering Science, 270, 118551.

 

2.Huang, Y., Xu, H. C., & Liao, J. L. 2020. Coarse-grained free-energy simulations of conformational state transitions in an adenosine 5′-triphosphate-binding cassette exporter. Chinese Journal of Chemical Physics, 336, 712-716.


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